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NEWS实时荧光定量PCR操作流程与注意事项——尊龙凯时FAQ
来源:凌德薇 日期:2025-03-06尊龙凯时为您提供关于FAQ总RNA提取的详细解读,特别是针对酚CHCL3抽提法及相关注意事项。在RNA提取过程中,必须选用新鲜的组织或细胞样本。对于冷冻样本,需尽量避免反复冻融,以免导致RNA降解。样本一旦离开活体或原生环境,内源RNase便开始对RNA进行降解,降解速度与RNase浓度及环境温度密切相关。推荐将新鲜组织浸泡于RNAKeeperTissueStabilizer(Vazyme#R501)中,可以使组织在室温下保存一周,或在4℃下保存一个月,亦可在-20℃/-80℃下进行长期保存。
在提取过程中,若样品量过大,可能造成裂解不充分,进而导致RNA收率下降。此外,若RNA保存时间过长,亦会加速降解。建议对提取的RNA进行纯度及完整性检测,并将其分管至-80℃进行长期保存或在-20℃下短期保存,尽快使用,以避免反复冻融带来的损害。
在使用CHCL3进行抽提时,如果RNA被基因组污染,需在低温环境(2℃-8℃)下高速离心。离心后,RNA会被抽提至上层水相,而中下层则为有机相,含有CHCL3,DNA则位于中层。常温下CHCL3与水易互溶,可能导致水相中出现少量基因组DNA污染。因此,吸取上层液体时应谨慎,防止吸入中层和下层液体。
对于加入异丙醇后未见RNA沉淀的情况,可尝试在4℃或-20℃下放置10-30分钟后再次离心。如仍无沉淀,建议采取吸取而非倾倒的方式以避免沉淀损失。
在使用gDNA-FilterColumns时,出现堵塞的常见原因包括样品用量过多和样品中富含肌纤维(如来自肌肉、心脏及皮肤等组织)。因此,使用时应适量减少样品量,并考虑使用液氮研磨以缓解堵柱现象。此外,若组织研磨或均质不充分,片段可能导致柱堵塞,建议在裂解后进行离心以去除大颗粒。
低RNA产量或无法提取RNA的原因可能包括样本保存不当、未能充分进行匀浆、或洗脱不完全。建议采集新鲜样本,或用液氮快速冷冻后存放于-70℃。在洗脱过程,建议将RNase-free的ddH2O滴加至纯化柱膜中央,充分洗脱以提高RNA的回收效率。
RNA的降解主要与样本质量及操作过程有关。若样本未及时保存或经历多次冻融,RNA往往会降解。处理过程中,电泳设备及耗材需确保为RNase-free,以避免降解风险。
在下游实验中,如遇到不理想的结果,可能是由于洗脱后RNA中残留盐离子或乙醇。此时需进行适当的二次洗涤,并在离心后室温放置以去除残留物质。
对于逆转录反应,建议使用含有基因组去除模块的逆转录试剂,以提高实验的准确性。此外,根据模板特性选择适宜的引物,并确保反应条件的优化,以提高扩增效率。
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